Il Collegio dei docenti, visto il curriculum dei vincitori del concorso e l'offerta didattica del Dottorato, suggerisce un piano di studi per ciascun dottorando entro un mese dal ricevimento di detto curriculum. Il Collegio assegna il piano di studi a ciascun dottorando. Alla fine del primo anno (31 ottobre) il dottorando deve aver completato due terzi degli esami e colloqui previsti, prerequisito per l'ammissione al secondo anno; i rimanenti esami e colloqui devono essere superati entro giugno dell'anno successivo. Alla fine del primo anno il dottorando presenta al Coordinatore un breve scritto (poche righe) in cui delinea la propria area di ricerca. Il Collegio dei Docenti, presa visione dell'interesse di ricerca dei dottorandi e della disponibilità dei docenti, assegna loro un tutore, che deve essere membro del collegio che seguira' il dottorando fino al completamento della tesi. E' responsabilità del tutore seguire lo svolgimento della tesi del dottorando ed informare il Collegio .

Nel periodo fra luglio ed ottobre del secondo anno il dottorando presenta al Coordinatore una relazione sullo stato di avanzamento del lavoro pianificato nel quale si delinea il progetto di tesi e la illustra di fronte ai membri del comitato-tesi ed al Collegio. Sulla base della relazione e del parere scritto del comitato-tesi (volto fra l'altro a delineare il grado di autonomia raggiunto dal dottorando) il Collegio delibera l'ammissione al terzo anno.

Durante il terzo anno, il dottorando svolge attività di ricerca i cui risultati verranno illustrati nella tesi di dottorato. Prima della fine del terzo anno il Collegio dei docenti propone per ogni settore disciplinare una apposita commissione per il conferimento del titolo di dottore di ricerca composta da tre membri italiani o stranieri ed invia tale proposta all'ufficio dottorati di ricerca.

All'inizio del quarto anno, il dottorando consegna al collegio dei docenti una versione preliminare della tesi. Tale versione preliminare deve contenere: una analisi sullo stato dell'arte, un inquadramento generale dei risultati, una descrizione dei risultati con particolare riferimento a quelli originali. Il dottorando presenta inoltre la tesi in un seminario di fronte ai membri del Collegio dei docenti e la illustra. Il Collegio formula il proprio giudizio e prepara per ogni dottorando un medaglione che descrive l'attività complessiva del candidato nell'ambito del triennio. I candidati inviano quindi ad ognuno dei tre membri della commissione per il conferimento del titolo di dottore di ricerca tale medaglione nonché una copia della propria tesi. Il Coordinatore concorda con i membri delle commissioni le date in cui inizieranno le prove. Le commissioni devono concludere i loro lavori entro il 30 giugno dell'anno successivo alla terminazione del programma di dottorato.